子供を日本で出産して(夫が日本人なので子供は生まれた際に自動的に日本国籍取得)、その後子供はロシア国籍取得(日本国籍喪失)を経たのですが、ロシアで生まれたわけではなく出生証明書がロシアで発行されていないので、その代わりに日本の市役所から発行された出生届受理証明書と戸籍謄本の翻訳認証したものを持っています。このたび子供のパスポートの更新で書類を使ったので、ついでにзагсのデータベースに入れてもらおうとзагсへ相談したのですが、出生証明書の番号がないとデータベースへ登録できないと言われました。皆様このようなケースにどのように対処してますでしょうか？

戸籍謄本や出生届受理証明書で、なにかしら「発行番号」の類ありますよね？
お手数と思いますが、翻訳認証で露翻訳する際、この「発行番号」のロシア語訳を強引に「出生証明番号」 （№ записи акта о рождении）にしたらいかがでしょうか。
日ロに限らないですが、無いなら無いなりに何か工夫してくれようとしたりする人、杓子定規な人、窓口対応する人によるところありますよね。
前者のように対応してくれる人に当たれば上手くいくのではと思いますが・・・
戸籍関係は法律家が頼りにならず結局自分で動くことばかりですが、一応法律家にご相談されるのが良いと思います。

アドバイスありがとうございます！確かにその時に対応してくれる人の裁量で変わってしまうこともありますよね。どうかこれからは上手くいきますように。
何箇所か相談して回答待ちです。